공과대학

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교수소개

생정정보학(유전체/전사체 데이터 분석)과 이를 위한 기계학습 및 인공신경망 응용에 대해 연구하고 있다.
세부 연구 주제:
- Bulk/single-cell RNA-Seq 데이터의 분석 및 SW개발, 분석 파이프라인 개발
- Whole genome/exome sequecing 데이터의 분석 및 SW/파이프라인 개발
- 유전체/전사체 빅데이터 분석을 위한 기계학습/AI의 활용
- 유전체/전사체 데이터 기반의 암 및 각종 질환의 기전 연구

학력

• [1992] 학사 성균관대학교 / 전자공학
• [1996] 석사 성균관대학교(자연과학캠퍼스) / 전자 / 통신 알고리즘
• [2003] 박사 New Jersey Institute of Technology / 전기및전자공학 / 유전체/의료 정보 분석

주요경력

• 삼성전자/정보통신총괄/통신연구소 (2003-03-01)
• 한국전자통신연구원 (ETRI) (1999-03-01)

주요연구분야

-. 기계학습/AI 기반 유전체/전사체 정보 분석 및 응용 SW개발
-. 단일세포 RNA-seq 데이터 분석 및 분석 SW개발
-. 전사체 어셈블리 어셈블리
-. SW 개발: github.com/combio-dku, sourceforge.net/projects/trareco/

컨설팅 가능 분야

-. 기계학습 응용 유전체/전사체 분석 SW 개발
-. bulk 및 single-cell RNA-seq 데이터 분석 및 분석 SW개발
- Whole genome/exome sequencing 데이터 분석 및 분석 SW개발

연구업적

• 연구보고서[20140203] 잡음에 강한 자동인지 T-DMB 재난방송 시스템 송수신 최적화 알고리즘 연구
• 연구보고서[20130130] Post Wi-Fi PHY 시뮬레이터 개발 및 간섭정렬 알고리듬 개발
• 연구보고서[20130124] 자동인지 T-DMB 재난방송 시스템 송수신 최적화 알고리즘 연구
• 연구보고서[20130124] 개선된 HD RADIO 등화 알고리즘 연구 개발
• 연구보고서[20120104] 자동인지 T-DMB 재난방송을 위한 동기/채널추정/채널보상 연구
• 연구보고서[20111028] ICT기반 차상제어시스템 적용을 위한 무선통신 기술분석 및 성능평가 방안 연구
• 연구보고서[20110630] 다중대각화와 트랠리스복조 연동을 이용한 다중사용자 다중안테나 전송시스템의 송수신 알고리즘에 관한 연구(2/2)
• 연구보고서[20101119] HD Radio 시스템규격 심화 연구 및 모의실험 테스트
• 연구보고서[20091130] 디지털라디오 방식 별 송수신 성능 비교
• 연구보고서[20091126] LTE-Advanced Femto cell 성능분석 및 간섭 문제해결 기술연구
• 연구보고서[20080131] T-DMB용 동일채널중계기 등화 기법연구
• 연구보고서[20071008] 차세대무선랜 기반 MIMO 수신 알고리즘 및 시뮬레이터 개발
• 연구보고서[20061201] 3Gbps급 4G 무선LAN 모뎀을 위한 LDPC Codec 설계 및 시뮬레이터 개발
• 연구보고서[20051031] 고속이동성을 갖는 무선 LAN의 수신 알고리즘 연구
• 일반논문[20240316] A Retrospective View of the Triple-Negative Breast Cancer Microenvironment: Novel Markers, Interactions, and Mechanisms of Tumor-Associated Components Using Public Single-Cell RNA-Seq Datasets
• 일반논문[20231201] StringFix: an annotation-guided transcriptome assembler improves the recovery of amino acid sequences from RNA-Seq reads
• 일반논문[20230701] Identification of ulcerative colitis-specific immune cell signatures from public single-cell RNA-seq data
• 일반논문[20230301] Role of lymphoid lineage cells aberrantly expressing alarmins S100A8/A9 in determining the severity of COVID-19
• 일반논문[20230301] Hierarchical cell-type identifier accurately distinguishes immune-cell subtypes enabling precise profiling of tissue microenvironment with single-cell RNA-sequencing
• 일반논문[20230201] Inhibition of CD82 improves colitis by increasing deubiquitination activities in NLRP3 by BRCC3
• 일반논문[20221130] Colon-Targeted eNAMPT-Specific Peptide Systems for Treatment of DSS-Induced Acute and Chronic Colitis in Mouse
• 일반논문[20220614] MarkerCount: A stable, count-based cell type identifier for single-cell RNA-seq experiments
• 일반논문[20210326] Machine learning based anti-cancer drug response prediction and search for predictor genes using cancer cell line gene expression
• 일반논문[20200505] Hormone Receptor-Status Prediction in Breast Cancer Using Gene Expression Profiles and Their Macroscopic Landscape
• 일반논문[20180904] TraRECo: a greedy approach based de novo transcriptome assembler with read error correction using consensus matrix
• 일반논문[20170801] Convergence and Density Evolution of a MIMO Detector Based on a Forward-Backward Recursion Over a Ring
• 일반논문[20170501] Performance of Iterative Soft Decision Feedback Equalizers for Single-Carrier Transmission
• 일반논문[20150501] Iterative Detection and Decoding of MIMO Signals Using Low-Complexity Soft-In/Soft-Out Detector
• 일반논문[20140601] Low-Complexity MIMO Detection Based on Belief Propagation Over Pairwise Graphs
• 일반논문[20121101] Antenna Ordering in Low Complexity MIMO detection based on Ring-type Markov Random Fields
• 일반논문[20120801] System-Level Performance of Spread Spectrum-Based Add-on Service Overlaid onto the Existing Terrestrial Digital Multimedia Broadcast Band
• 일반논문[20120501] Impact of Femtocell Deployment on Existing Macrocells
• 일반논문[20110501] A Comparison of MIMO Detection Algorithms with Channel Coding in Frequency Selective Fading Channel Environments
• 일반논문[20100819] Asymmetrically Optimized Poly-diagonalization for Low Complexity MIMO detection
• 일반논문[20091001] Hybrid Beam-Forming and Beam-Switching for OFDM Based Wireless Personal Area Networks
• 일반논문[20080901] Performance of Superposition coded Broadcast/Unicast Service Overlay systems
• 일반논문[20080801] A Detection Algorithm for Multi-Input Multi-Output (MIMO) Transmission using Poly-Diagonalization and Trellis Decoding
• 일반논문[20080701] Superposition of Broadcast and Unicast in Wireless Cellular Systems
• 일반논문[20080701] Ricean Model Based Design and Analysis of Sub-Channelized Orthogonal Frequency Division Multiplexing
• 저서/역서[20191219] 기계학습과인공신경망
• 저서/역서[20150829] 무선이동통신기술의 이해 - 물리계층중심
• 저서/역서[20130225] 무선 및 이동통신
• 저서/역서[20080721] 확률과 랜덤과정 기초와응용
• 지식재산권[20170530] ＤＮＡ 샷건 시퀀싱 또는 ＲＮＡ 전사체 어셈블리를 위한 콘티그 프로파일 및 콘티그 형성 방법
• 지식재산권[20121031] 다중입력 다중출력 시스템을 위한 복호기 및 복호 방법
• 학술발표[20130201] Utilizing Repeaters to reduce the interference from spread spectrum based Add-on service overlaid onto the existing T-DMB
• 학술발표[20121017] Convergence of Gaussian Belief Propagation over a Ring-type Graphical Model
• 학술발표[20120718] Low complexity MIMO detector based on ring-type Markov random fileds with Antenna aordering
• 학술발표[20120112] Graph based low Complexity MIMO detection with Intermediate Hard-Decision
• 학술발표[20110929] Interference Mitigation in Heterogeneous cellular networks of macro and femto cells
• 학술발표[20110621] Bayesian Prediction Scheme for Game-structured Slotted ALOHA
• 학술발표[20110516] A Low Complexity MIMO detection based on Pair-wise Markov Random Fields
• 학술발표[20110122] Comparisons of Two Detectors for a Tradeoff between Complexity and Performance in MIMO-OFDM Systems
• 학술발표[20100821] Soft-Output Signal Detectors: Performance Comparisons in Wireless MIMO Communication Systems
• 학술발표[20100617] HD-Radio와 DAB 시스템의 성능비교
• 학술발표[20080331] A Detection Algorithm for MIMO Transmission using Poly-Diagonalization and Trellis Decoding
• 학술발표[20070930] Row-splitting design of Low-Density Parity-Check Codes for Gbps transmission
• 학술발표[20070930] A new MIMO system for Gbps transmission
• 학술발표[20070903] A Comparison of Opportunistic Transmission Schemes with Reduced Channel Information Feedback in OFDMA Downlink
• 학술발표[20070903] System Level Performance of Broadcast/Unicast Service Overlay Using Superposition Coding
• 학술발표[20060713] Performance of Channel shortening time-domain equalizer in WLAN environment
• 학술발표[20051128] MSDU-based ARQ scheme for IP-level Performance Maximization

캠퍼스별 교무팀